Esztergomban és országos szinten is egyre komolyabb oktatási problémát jelent az általános iskolák közötti szegregáció erősödése. Az egyházi és nem minden esetben körzeti alapon működő iskolák térnyerése miatt egyes intézmények már az első osztályos felvételnél kiszűrhetik a nehezebben tanítható, több figyelmet vagy támogatást igénylő gyermekeket. Ennek következtében ezek a tanulók más iskolákban koncentrálódnak, ami pedagógiai, társadalmi és esélyegyenlőségi szempontból is súlyos problémát okoz. Esztergomban ez a folyamat különösen a Babits Mihály Általános Iskolát érinti, ahol nagyobb arányban jelenhetnek meg azok a gyerekek, akiket más intézmények nem vállalnak vagy nem tartanak meg. Pedagógiai szempontból az általános iskola alapfeladata az lenne, hogy minden gyermeket megtanítson írni, olvasni és számolni, nem pedig az, hogy a nehezebben tanítható tanulókat már az iskola kezdetén kiszorítsa. A jelenlegi működés hosszú távon növeli az egyenlőtlenségeket, rontja a gyermekek esélyeit, és a város egész oktatási rendszerére negatív hatással van. Fontos lenne az iskolák közötti tanulói arányok, a felvételi gyakorlatok és az esélyegyenlőségi szempontok felülvizsgálata, hogy minden gyermek méltányos és megfelelő oktatási környezethez jusson.